Los resultados de los análisis de las llamadas "biopsias líquidas" en pacientes con cáncer de pulmón no microcítico
El método ha arrojado una tasa positiva verdadera del 75% y una tasa negativa verdadera del 100%.
Un nuevo método para determinar la secuencia de moléculas en el ADN se puede usar para detectar pequeños fragmentos de material genético canceroso en muestras de sangre de pacientes con cáncer de pulmón con un alto grado de precisión, según una nueva investigación publicada este miércoles en la revista 'Annals of Oncology'.
Los resultados de los análisis de las llamadas "biopsias líquidas" en pacientes con cáncer de pulmón no microcítico (CPCNP, por sus siglas en inglés) muestran que es posible identificar las variantes genéticas que impulsan el cáncer o lo hacen resistente al tratamiento. Esto ofrece la posibilidad de que los médicos utilicen biopsias líquidas como ayuda para elegir el mejor tratamiento para los pacientes según la composición genética de sus tumores.
Investigadores en Estados Unidos utilizaron un método de análisis de muestras de sangre de pacientes denominado "secuenciación ultra-profunda de próxima generación". Esto implica leer los fragmentos de ADN que los tumores han liberado en el torrente sanguíneo, conocido como ADN libre de células (cfDNA, por sus siglas en inglés), un promedio de 50.000 veces para garantizar la mayor precisión en la detección de variantes de cualquiera de los 37 genes comúnmente involucrados en el cáncer de pulmón.
La proporción de cfDNA de los tumores es muy pequeña en comparación con cfDNA de las células no cancerosas en la sangre, por lo que es importante poder detectar las señales débiles de los tumores de cfDNA y distinguir entre esto y el ruido de fondo abrumador de todo lo demás. Para hacer esto, también se secuenciaron los glóbulos blancos de los pacientes y se usaron para filtrar las señales no cancerosas de la médula ósea, un proceso llamado "filtrado de hematopoyesis clonal". Se incorporó la información de la secuenciación ultragrande de próxima generación a un algoritmo informático recientemente desarrollado que utilizó el aprendizaje automático para separar el "trigo" de la "paja".
Los investigadores del Centro de Cáncer Memorial Sloan Kettering (MSK, por sus siglas en inglés), en Nueva York; el Centro de Cáncer MD Anderson, en Texas, y el Instituto de Cáncer Dana-Farber, Boston, recogieron muestras de sangre de 127 pacientes con CPNM avanzado recién diagnosticado que se había propagado (metastatizado) a otras partes del cuerpo o que tuvieron metástasis recurrentes.
Hubo tres grupos de pacientes: El primero, compuesto por 91 sujetos en los que se identificaron mutaciones genéticas que conducían el cáncer o resistentes al tratamiento a partir de una muestra de tejido tumoral (una biopsia de tejido); el segundo, 19 pacientes para los cuales la biopsia de tejido no había detectado ninguna de estas mutaciones; y un tercero 17 pacientes para los que no se disponía de biopsia de tejido o era insuficiente para el análisis.
Con el fin de comparar el rendimiento de la biopsia líquida con la biopsia de tejido de manera imparcial, la biopsia líquida se probó "a ciegas", sin saber lo que ya se había encontrado en la biopsia de tejido. Esto permitió a los investigadores extrapolar la utilidad de la biopsia líquida para detectar mutaciones con precisión en pacientes sin tejido adecuado para analizar.
Tasa positiva verdadera del 75%
El doctor Bob T. Li, oncólogo médico de MSK, quien dirigió la investigación en nombre de 'Actionable Genome Consortium', apunta: "Encontramos que de los 91 pacientes en los que la biopsia de tejido había encontrado mutaciones causantes de cáncer, el análisis de la biopsia líquida detectó 68, dando una tasa positiva verdadera del 75 por ciento. Entre los 19 pacientes sin mutaciones detectadas en la biopsia tisular, la biopsia líquida tampoco detectó ninguna mutación, lo que significa que no hubo falsos positivos y dio una tasa negativa verdadera del cien por cien". Este experto señala que la verdadera tasa positiva del 75 por ciento es comparable favorablemente con otros métodos digitales para detectar mutaciones conductoras del cáncer de pulmón.
Entre el tercer grupo de 17 pacientes para los cuales no se disponía de biopsia de tejido, el análisis de ADNcc detectó mutaciones que conducen al cáncer en cuatro pacientes. En un paciente, se confirmó posteriormente mediante una biopsia de tejido, mientras que los otros tres no tuvieron biopsias de tejido posteriores. De los 13 pacientes restantes, las biopsias de tejido posteriores confirmaron mutaciones en dos de ellos, mientras que los otros 11 no tuvieron biopsias posteriores.
Investigaciones anteriores en MSK han demostrado que la biopsia líquida se puede tomar y analizar en aproximadamente nueve días, en comparación con los 20 días para las biopsias de tejido, una diferencia de tiempo que puede ser importante para pacientes muy enfermos que pueden deteriorarse rápidamente.
Las mutaciones que impulsaron el cáncer o que lo hicieron resistente al tratamiento detectado por el tejido y las biopsias líquidas incluyeron cambios en los genes EGFR, KRAS, ALK, ROS1, BRAF, HER2, RET y MET, para los cuales existen tratamientos específicos, así como nuevos fármacos o combinaciones de medicamentos en desarrollo.
Li concluye: "La biopsia líquida es un desarrollo tecnológico prometedor que podría ayudar a mejorar la atención de los pacientes. Estamos realizando más investigaciones sobre esta nueva prueba, y estos últimos resultados son un paso en la dirección correcta para el campo de la biopsia líquida".